Akiba’s Trip: The Animation berlatar di Akihabara, distrik terkenal di Tokyo yang menjadi pusat budaya otaku dan teknologi. Ceritanya mengikuti Tamotsu Denkigai, seorang pemuda yang secara tidak sengaja terlibat dalam pertempuran melawan makhluk misterius bernama “Bugged Ones.” Makhluk-makhluk ini terlihat seperti manusia biasa, namun mereka sebenarnya parasit yang mengambil alih tubuh manusia dan hanya bisa dikalahkan dengan cara menghilangkan pakaian mereka untuk mengekspos kulit mereka ke sinar matahari.
Ketika Tamotsu diserang oleh salah satu Bugged Ones, dia diselamatkan oleh seorang gadis kuat bernama Matome Mayonaka. Dalam pertempuran itu, Tamotsu terluka parah dan di ambang kematian, tetapi Matome menyelamatkannya dengan menjadikannya “Synthister,” makhluk yang mirip dengan Bugged Ones namun tetap memiliki kendali atas dirinya sendiri.
Setelah mendapatkan kekuatan baru, Tamotsu bergabung dengan Matome dan teman-temannya untuk melindungi Akihabara dari ancaman Bugged Ones. Bersama-sama, mereka berjuang melawan musuh dengan cara mencopot pakaian mereka dalam pertempuran yang penuh aksi dan humor.
