Busou Shoujo Machiavellianism: Akademi Swasta Simbiosis Aichi awalnya adalah sekolah menengah atas untuk anak perempuan kelas atas. Ketika menjadi mahasiswi, karena takut, para gadis tersebut meminta izin membawa senjata ke sekolah. Ketika hal itu diberlakukan, sebuah organisasi mirip korps main hakim sendiri yang beranggotakan lima orang yang disebut “Lima Pedang Tertinggi” juga dibentuk.
Setelah beberapa generasi, Lima Pedang akhirnya menjadi kelompok yang mengoreksi siswa bermasalah, dan akademi mulai secara proaktif menerima siswa tersebut untuk mengoreksi mereka.
Nomura Fudou dikirim ke sekolah ini setelah menjadi bagian dari perkelahian besar. Apa yang akan dia lakukan ketika satu-satunya pilihan yang dia miliki setelah mendaftar adalah dikeluarkan dari sekolah itu atau dikoreksi seperti siswa laki-laki lainnya…dengan dipaksa berpakaian dan bertingkah seperti perempuan!
