Katsute Kami Datta Kemono-tachi e berlatar di dunia di mana perang sipil terjadi antara dua wilayah, yang dikenal sebagai Negara Utara dan Selatan. Untuk memenangkan perang, pasukan Utara menciptakan makhluk-makhluk super kuat yang disebut “Incarnates,” manusia yang diubah menjadi monster dengan kekuatan besar.
Hank, pemimpin pasukan Incarnates, dan pasukannya, yang dahulu dianggap sebagai pahlawan, mulai kehilangan kendali atas diri mereka sendiri dan berubah menjadi makhluk yang berbahaya bahkan setelah perang berakhir. Ketika para Incarnates satu per satu menjadi ancaman, Hank bersumpah untuk memburu mantan teman-temannya dan membebaskan mereka dari penderitaan mereka.
Ceritanya juga mengikuti Schaal, seorang gadis muda yang ayahnya, salah satu Incarnates, dibunuh oleh Hank. Schaal memutuskan untuk mencari Hank dan mengetahui alasan di balik tindakannya, sambil menghadapi kebenaran tentang para Incarnates yang dulunya adalah manusia, kini menjadi monster.
